Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK8P49336 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK8P49336 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK8P49336 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK8P49336 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK8P49336 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK8P49336 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK8P49336 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK8P49336 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK8P49336 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK8P49336 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK8P49336 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK8P49336 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK8P49336 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK8P49336 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK8P49336 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK8P49336 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK8P49336 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK8P49336 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK8P49336 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK8P49336 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK8P49336 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK8P49336 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK8P49336 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK8P49336 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK8P49336 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK8P49336 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK8P49336 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK8P49336 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK8P49336 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK8P49336 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK8P49336 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK8P49336 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK8P49336 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK8P49336 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK8P49336 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK8P49336 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK8P49336 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK8P49336 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK8P49336 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK8P49336 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK8P49336 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK8P49336 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK8P49336 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK8P49336 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK8P49336 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK8P49336 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK8P49336 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK8P49336 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK8P49336 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK8P49336 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK8P49336 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK8P49336 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK8P49336 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK8P49336 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK8P49336 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK8P49336 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK8P49336 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK8P49336 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK8P49336 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK8P49336 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK8P49336 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK8P49336 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK8P49336 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK8P49336 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK8P49336 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK8P49336 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK8P49336 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK8P49336 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK8P49336 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK8P49336 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK8P49336 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK8P49336 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK8P49336 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK8P49336 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK8P49336 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK8P49336 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK8P49336 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK8P49336 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK8P49336 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK8P49336 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK8P49336 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK8P49336 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK8P49336 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK8P49336 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK8P49336 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK8P49336 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK8P49336 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK8P49336 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK8P49336 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK8P49336 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK8P49336 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK8P49336 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK8P49336 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK8P49336 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK8P49336 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK8P49336 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK8P49336 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK8P49336 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK8P49336 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms