Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms