Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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UBXN7O94888 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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UBXN7O94888 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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UBXN7O94888 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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UBXN7O94888 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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UBXN7O94888 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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UBXN7O94888 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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