Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB23Q9ULC3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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