Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BCO2Q9BYV7 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms