Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
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SAMD8Q96LT4 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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