Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM3CQ92520 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms