Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC38Q502W7 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms