Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLPPQ16740 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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