Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms