Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PUM3Q15397 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
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