Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFSF9P41273 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms