Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E1P29083 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms