Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms