Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms