Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TTC21AQ8NDW8 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms