Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms