Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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RAB35Q15286 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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RAB35Q15286 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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RAB35Q15286 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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RAB35Q15286 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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RAB35Q15286 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB35Q15286 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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