Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB3P54753 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms