Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRPRAP08240 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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