Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCAO15360 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCAO15360 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCAO15360 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCAO15360 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCAO15360 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCAO15360 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCAO15360 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCAO15360 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCAO15360 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCAO15360 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCAO15360 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCAO15360 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCAO15360 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCAO15360 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCAO15360 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCAO15360 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCAO15360 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCAO15360 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCAO15360 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCAO15360 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FANCAO15360 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCAO15360 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCAO15360 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCAO15360 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCAO15360 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCAO15360 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCAO15360 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCAO15360 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCAO15360 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCAO15360 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCAO15360 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCAO15360 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCAO15360 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCAO15360 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCAO15360 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCAO15360 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCAO15360 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCAO15360 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCAO15360 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCAO15360 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCAO15360 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCAO15360 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCAO15360 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCAO15360 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCAO15360 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCAO15360 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FANCAO15360 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCAO15360 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCAO15360 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCAO15360 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCAO15360 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCAO15360 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCAO15360 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCAO15360 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCAO15360 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FANCAO15360 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FANCAO15360 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FANCAO15360 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FANCAO15360 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FANCAO15360 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
FANCAO15360 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
FANCAO15360 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FANCAO15360 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FANCAO15360 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FANCAO15360 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
FANCAO15360 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
FANCAO15360 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FANCAO15360 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FANCAO15360 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FANCAO15360 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCAO15360 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCAO15360 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCAO15360 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCAO15360 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCAO15360 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCAO15360 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCAO15360 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCAO15360 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCAO15360 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCAO15360 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCAO15360 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCAO15360 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCAO15360 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCAO15360 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCAO15360 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCAO15360 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCAO15360 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCAO15360 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCAO15360 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCAO15360 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCAO15360 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCAO15360 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCAO15360 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCAO15360 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCAO15360 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCAO15360 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCAO15360 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCAO15360 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FANCAO15360 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms