Protein–RNA interactions for Protein: O00237

RNF103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF103O00237 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF103O00237 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF103O00237 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF103O00237 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF103O00237 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF103O00237 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF103O00237 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF103O00237 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF103O00237 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF103O00237 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF103O00237 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF103O00237 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF103O00237 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF103O00237 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF103O00237 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF103O00237 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF103O00237 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF103O00237 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF103O00237 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF103O00237 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF103O00237 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF103O00237 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF103O00237 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF103O00237 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF103O00237 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF103O00237 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF103O00237 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF103O00237 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF103O00237 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF103O00237 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF103O00237 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF103O00237 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF103O00237 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF103O00237 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF103O00237 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF103O00237 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF103O00237 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF103O00237 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF103O00237 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF103O00237 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF103O00237 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF103O00237 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF103O00237 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF103O00237 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF103O00237 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF103O00237 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF103O00237 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF103O00237 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF103O00237 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF103O00237 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF103O00237 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF103O00237 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms