Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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USP20Q9Y2K6 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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