Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9BQ9UPX0 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms