Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTNNA3Q9UI47 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms