Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO1Q9P1Z2 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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