Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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GDE1Q9NZC3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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GDE1Q9NZC3 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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GDE1Q9NZC3 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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GDE1Q9NZC3 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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GDE1Q9NZC3 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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GDE1Q9NZC3 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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GDE1Q9NZC3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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GDE1Q9NZC3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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GDE1Q9NZC3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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GDE1Q9NZC3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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GDE1Q9NZC3 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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GDE1Q9NZC3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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GDE1Q9NZC3 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDE1Q9NZC3 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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