Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIOK2Q9BVS4 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms