Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC7Q96M83 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms