Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms