Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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SP6Q3SY56 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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SP6Q3SY56 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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SP6Q3SY56 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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SP6Q3SY56 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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SP6Q3SY56 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SP6Q3SY56 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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