Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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