Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTBP49356 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTBP49356 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTBP49356 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTBP49356 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTBP49356 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTBP49356 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTBP49356 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTBP49356 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTBP49356 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTBP49356 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTBP49356 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTBP49356 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTBP49356 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTBP49356 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTBP49356 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTBP49356 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTBP49356 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTBP49356 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTBP49356 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FNTBP49356 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTBP49356 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTBP49356 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTBP49356 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTBP49356 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTBP49356 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTBP49356 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTBP49356 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTBP49356 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTBP49356 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTBP49356 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTBP49356 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTBP49356 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTBP49356 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTBP49356 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTBP49356 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTBP49356 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTBP49356 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTBP49356 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTBP49356 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTBP49356 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTBP49356 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTBP49356 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTBP49356 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTBP49356 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTBP49356 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTBP49356 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTBP49356 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTBP49356 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTBP49356 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTBP49356 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTBP49356 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTBP49356 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTBP49356 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTBP49356 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTBP49356 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTBP49356 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTBP49356 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTBP49356 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTBP49356 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTBP49356 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTBP49356 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTBP49356 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTBP49356 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTBP49356 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTBP49356 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FNTBP49356 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FNTBP49356 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms