Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF888P0CJ79 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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