Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MBD5Q9P267 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms