Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOMER3Q9NSC5 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms