Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNM2

Trim46, Tripartite motif-containing protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim46Q7TNM2 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim46Q7TNM2 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trim46Q7TNM2 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim46Q7TNM2 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim46Q7TNM2 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim46Q7TNM2 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim46Q7TNM2 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim46Q7TNM2 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim46Q7TNM2 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim46Q7TNM2 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim46Q7TNM2 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim46Q7TNM2 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim46Q7TNM2 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim46Q7TNM2 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim46Q7TNM2 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim46Q7TNM2 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim46Q7TNM2 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim46Q7TNM2 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim46Q7TNM2 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim46Q7TNM2 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim46Q7TNM2 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim46Q7TNM2 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim46Q7TNM2 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim46Q7TNM2 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim46Q7TNM2 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim46Q7TNM2 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim46Q7TNM2 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim46Q7TNM2 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim46Q7TNM2 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim46Q7TNM2 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim46Q7TNM2 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim46Q7TNM2 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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