Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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NPTX1Q15818 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPTX1Q15818 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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