Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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