Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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