Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX3Q13761 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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