Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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