Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms