Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms