Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms