Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DESP17661 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DESP17661 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DESP17661 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DESP17661 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DESP17661 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DESP17661 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DESP17661 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DESP17661 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DESP17661 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DESP17661 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DESP17661 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DESP17661 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DESP17661 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DESP17661 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DESP17661 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DESP17661 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DESP17661 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DESP17661 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DESP17661 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DESP17661 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DESP17661 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms