Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RARBP10826 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RARBP10826 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RARBP10826 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RARBP10826 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RARBP10826 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RARBP10826 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RARBP10826 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RARBP10826 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RARBP10826 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RARBP10826 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RARBP10826 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RARBP10826 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RARBP10826 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RARBP10826 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RARBP10826 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RARBP10826 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RARBP10826 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RARBP10826 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RARBP10826 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RARBP10826 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RARBP10826 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RARBP10826 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RARBP10826 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RARBP10826 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RARBP10826 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RARBP10826 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RARBP10826 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RARBP10826 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RARBP10826 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RARBP10826 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RARBP10826 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RARBP10826 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RARBP10826 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RARBP10826 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RARBP10826 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARBP10826 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARBP10826 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARBP10826 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARBP10826 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARBP10826 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARBP10826 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARBP10826 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARBP10826 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARBP10826 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARBP10826 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARBP10826 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RARBP10826 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARBP10826 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms