Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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UBXN7O94888 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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UBXN7O94888 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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UBXN7O94888 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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UBXN7O94888 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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