Protein–RNA interactions for Protein: A6NMD2

GOLGA8J, Golgin subfamily A member 8J, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8JA6NMD2 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GOLGA8JA6NMD2 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GOLGA8JA6NMD2 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GOLGA8JA6NMD2 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GOLGA8JA6NMD2 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GOLGA8JA6NMD2 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GOLGA8JA6NMD2 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GOLGA8JA6NMD2 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GOLGA8JA6NMD2 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GOLGA8JA6NMD2 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GOLGA8JA6NMD2 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GOLGA8JA6NMD2 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GOLGA8JA6NMD2 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GOLGA8JA6NMD2 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GOLGA8JA6NMD2 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GOLGA8JA6NMD2 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GOLGA8JA6NMD2 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GOLGA8JA6NMD2 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GOLGA8JA6NMD2 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GOLGA8JA6NMD2 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GOLGA8JA6NMD2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GOLGA8JA6NMD2 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GOLGA8JA6NMD2 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GOLGA8JA6NMD2 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GOLGA8JA6NMD2 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GOLGA8JA6NMD2 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GOLGA8JA6NMD2 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GOLGA8JA6NMD2 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GOLGA8JA6NMD2 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GOLGA8JA6NMD2 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GOLGA8JA6NMD2 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GOLGA8JA6NMD2 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GOLGA8JA6NMD2 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GOLGA8JA6NMD2 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GOLGA8JA6NMD2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms