Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMPRSS4Q9NRS4 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMPRSS4Q9NRS4 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms